Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ERF
Ідентифікатори
Символи
ERF , CRS4, PE-2, PE2, ETS2 repressor factor, CHYTS
Зовнішні ІД
OMIM : 611888 MGI: 109637 HomoloGene: 68516 GeneCards: ERF
Пов'язані генетичні захворювання
isolated scaphocephaly [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0007067 мітоз • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 42.25 – 42.26 Mb
Хр. 7: 25.24 – 25.25 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
ERF (англ. ETS2 repressor factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот , а молекулярна маса — 58 703[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKTPADTGFA FPDWAYKPES SPGSRQIQLW HFILELLRKE EYQGVIAWQG
DYGEFVIKDP DEVARLWGVR KCKPQMNYDK LSRALRYYYN KRILHKTKGK
RFTYKFNFNK LVLVNYPFID VGLAGGAVPQ SAPPVPSGGS HFRFPPSTPS
EVLSPTEDPR SPPACSSSSS SLFSAVVARR LGRGSVSDCS DGTSELEEPL
GEDPRARPPG PPDLGAFRGP PLARLPHDPG VFRVYPRPRG GPEPLSPFPV
SPLAGPGSLL PPQLSPALPM TPTHLAYTPS PTLSPMYPSG GGGPSGSGGG
SHFSFSPEDM KRYLQAHTQS VYNYHLSPRA FLHYPGLVVP QPQRPDKCPL
PPMAPETPPV PSSASSSSSS SSSPFKFKLQ PPPLGRRQRA AGEKAVAGAD
KSGGSAGGLA EGAGALAPPP PPPQIKVEPI SEGESEEVEV TDISDEDEED
GEVFKTPRAP PAPPKPEPGE APGASQCMPL KLRFKRRWSE DCRLEGGGGP
AGGFEDEGED KKVRGEGPGE AGGPLTPRRV SSDLQHATAQ LSLEHRDS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші