Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXE3
Ідентифікатори
Символи
FOXE3 , FKHL12, FREAC8, forkhead box E3, AAT11, ASGD2, CTRCT34
Зовнішні ІД
OMIM : 601094 MGI: 1353569 GeneCards: FOXE3
Пов'язані генетичні захворювання
cataract 34 multiple types , early-onset posterior polar cataract [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• positive regulation of lens epithelial cell proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of lens fiber cell differentiation • розвиток клітин • positive regulation of epithelial cell proliferation • iris morphogenesis • cornea development in camera-type eye • negative regulation of apoptotic process • ciliary body morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • trabecular meshwork development • camera-type eye development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • розвиток ока • lens development in camera-type eye • mRNA transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 47.42 – 47.42 Mb
Хр. 4: 114.78 – 114.78 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
FOXE3 (англ. Forkhead box E3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 319 амінокислот , а молекулярна маса — 33 234[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAGRSDMDPP AAFSGFPALP AVAPSGPPPS PLAGAEPGRE PEEAAAGRGE
AAPTPAPGPG RRRRRPLQRG KPPYSYIALI AMALAHAPGR RLTLAAIYRF
ITERFAFYRD SPRKWQNSIR HNLTLNDCFV KVPREPGNPG KGNYWTLDPA
AADMFDNGSF LRRRKRFKRA ELPAHAAAAP GPPLPFPYAP YAPAPGPALL
VPPPSAGPGP SPPARLFSVD SLVNLQPELA GLGAPEPPCC AAPDAAAAAF
PPCAAAASPP LYSQVPDRLV LPATRPGPGP LPAEPLLALA GPAAALGPLS
PGEAYLRQPG FASGLERYL
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Semina E.V., Brownell I., Mintz-Hittner H.A., Murray J.C., Jamrich M. (2001). Mutations in the human forkhead transcription factor FOXE3 associated with anterior segment ocular dysgenesis and cataracts. Hum. Mol. Genet . 10 : 231—236. PMID 11159941 DOI :10.1093/hmg/10.3.231
Wang Y., Li W., Wang Y., Huang Y. (2012). Growth inhibition of human lens epithelial cells by short hairpin RNA in transcription factor forkhead box E3 (FOXE3). Graefes Arch. Clin. Exp. Ophthalmol . 250 : 999—1007. PMID 22527307 DOI :10.1007/s00417-012-1944-5
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші