Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
JUNB
Ідентифікатори
Символи
JUNB , AP-1, JunB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit
Зовнішні ІД
OMIM : 165161 MGI: 96647 HomoloGene: 7390 GeneCards: JUNB
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • Хроматин • клітинне ядро • transcription factor AP-1 complex • transcription regulator complex
Біологічний процес
• cellular response to calcium ion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cell death • osteoclast differentiation • labyrinthine layer blood vessel development • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • regulation of cell cycle • васкулогенез • embryonic process involved in female pregnancy • response to lipopolysaccharide • decidualization • regulation of cell population proliferation • trophectodermal cell differentiation • osteoblast differentiation • positive regulation of cell differentiation • response to radiation • osteoblast proliferation • GO:0006928 клітинний процес • response to cAMP • response to mechanical stimulus • transcription, DNA-templated • cellular response to hormone stimulus • response to cytokine • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • response to organic substance
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 12.79 – 12.79 Mb
Хр. 8: 85.7 – 85.71 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
JUNB (англ. JunB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот , а молекулярна маса — 35 879[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MCTKMEQPFY HDDSYTATGY GRAPGGLSLH DYKLLKPSLA VNLADPYRSL
KAPGARGPGP EGGGGGSYFS GQGSDTGASL KLASSELERL IVPNSNGVIT
TTPTPPGQYF YPRGGGSGGG AGGAGGGVTE EQEGFADGFV KALDDLHKMN
HVTPPNVSLG ATGGPPAGPG GVYAGPEPPP VYTNLSSYSP ASASSGGAGA
AVGTGSSYPT TTISYLPHAP PFAGGHPAQL GLGRGASTFK EEPQTVPEAR
SRDATPPVSP INMEDQERIK VERKRLRNRL AATKCRKRKL ERIARLEDKV
KTLKAENAGL SSTAGLLREQ VAQLKQKVMT HVSNGCQLLL GVKGHAF
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Phinney D.G., Tseng S.W., Ryder K. (1995). Complex genetic organization of junB: multiple blocks of flanking evolutionarily conserved sequence at the murine and human junB loci. Genomics . 28 : 228—234. PMID 8530030 DOI :10.1006/geno.1995.1135
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 111 : 12432—12437. PMID 25114211 DOI :10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші