SMAD5

SMAD5
Ідентифікатори
Символи	SMAD5, DWFC, JV5-1, MADH5, SMAD family member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 603110 MGI: 1328787 HomoloGene: 4313 GeneCards: SMAD5
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • SMAD protein complex • transcription regulator complex • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • germ cell development • ureteric bud development • cardiac muscle contraction • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • embryonic pattern specification • осифікація • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • cellular response to BMP stimulus • BMP signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Mullerian duct regression • protein phosphorylation • cartilage development • positive regulation of osteoblast differentiation • erythrocyte differentiation • bone development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • osteoblast fate commitment • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4090	17129
Ensembl	ENSG00000113658	ENSMUSG00000021540
UniProt	Q99717	P97454
RefSeq (мРНК)	NM_005903 NM_001001419 NM_001001420	NM_001164041 NM_001164042 NM_008541
RefSeq (білок)	NP_001001419 NP_001001420 NP_005894	NP_001157513 NP_001157514 NP_032567
Локус (UCSC)	Хр. 5: 136.13 – 136.19 Mb	Хр. 13: 56.85 – 56.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMAD5 (англ. SMAD family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 258.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSMASLFSF		TSPAVKRLLG		WKQGDEEEKW		AEKAVDALVK		KLKKKKGAME
ELEKALSSPG		QPSKCVTIPR		SLDGRLQVSH		RKGLPHVIYC		RVWRWPDLQS
HHELKPLDIC		EFPFGSKQKE		VCINPYHYKR		VESPVLPPVL		VPRHNEFNPQ
HSLLVQFRNL		SHNEPHMPQN		ATFPDSFHQP		NNTPFPLSPN		SPYPPSPASS
TYPNSPASSG		PGSPFQLPAD		TPPPAYMPPD		DQMGQDNSQP		MDTSNNMIPQ
IMPSISSRDV		QPVAYEEPKH		WCSIVYYELN		NRVGEAFHAS		STSVLVDGFT
DPSNNKSRFC		LGLLSNVNRN		STIENTRRHI		GKGVHLYYVG		GEVYAECLSD
SSIFVQSRNC		NFHHGFHPTT		VCKIPSSCSL		KIFNNQEFAQ		LLAQSVNHGF
EAVYELTKMC		TIRMSFVKGW		GAEYHRQDVT		STPCWIEIHL		HGPLQWLDKV
LTQMGSPLNP		ISSVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Zavadil J., Brezinova J., Svoboda P., Zemanova Z., Michalova K. (1997). Smad5, a tumor suppressor candidate at 5q31.1, is hemizygously lost and not mutated in the retained allele in human leukemia cell line HL60. Leukemia. 11: 1187—1192. PMID 9264367 DOI:10.1038/sj.leu.2400750
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 DOI:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
• Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00012-X
• Wrana J.L., Attisano L. (2000). The Smad pathway. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 5—13. PMID 10708948 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00024-6
• Miyazono K. (2000). TGF-beta signaling by Smad proteins. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 15—22. PMID 10708949 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00025-8

Див. також

• Хромосома 5