清明节加班都算加班费，假期当天加班要支付三倍工资，其余假期加班应当支付双倍工资。加班费需要扣税，加班费也属于工资，且不属于国家规定的免税项目，应当缴纳个人所得税。
清明节加班都算加班费用。在清明节当天加班的要算300%的工资。其余假期加班的，按照休息日加班的200%
工资计算：清明期间每日的加班工资计算方法为：节假日(清明当天)加班工资=加班工资的计算基数÷21.75×300%;休息日加班工资=加班工资的计算基数÷21.75×200%。
加班费要扣税。加班费属于员工正常的薪资，并不属于国家统一规定的免税项目，所以加班费应当计入个税起征点，即并入当月的工薪收入的个人所得税，进行依法纳税。
法律依据：
《个人所得税法》第二条规定，下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
加班费一般是按基本工资而不是全额工资为基数算的。根据我国劳动法的规定，加班工资是按照劳动者正常工作时间工资相应的倍数计算的。找法网提醒您，如果劳动合同中用人单位和劳动者之间对工资有约定，则应当按照不低于所约定的工资标准去确定加班工资，即此时加班工资不一定按基本工资计算，而按照约定的计算。若没有约定，则加班工资通常按正常工作时间的工资、至少也是基本工资计算。
