物流纠纷的处理方式主要包括协商、调解、仲裁、诉讼等。当发生纠纷时，当事人之间可以协商解决；如果当事人不愿意协商或者协商不成的，则可以向调解组织申请调解、根据达成的仲裁协议申请仲裁、直接向人民法院起诉等。
法律依据
《消费者权益保护法》第三十九条消费者和经营者发生消费者权益争议的，可以通过下列途径解决：（一）与经营者协商和解；（二）请求消费者协会或者依法成立的其他调解组织调解；（三）向有关行政部门投诉；（四）根据与经营者达成的仲裁协议提请仲裁机构仲裁；（五）向人民法院提起诉讼。