离婚时可以通过夫妻协议的方式分割经济适用房，也可以通过向法院起诉的方式予以分割。
如果夫妻选择起诉分割的话，经济适用房属于夫妻共同财产的，按照离婚房产分割的原则，参照照顾女方、照顾抚养子女一方、照顾无过错方的原则确定经济适用房归谁。
如果是夫妻个人财产的，则离婚时经济适用房归个人所有。如果夫妻选择协议分割的话，夫妻协议经济适用房归谁的，按照协议的约定。
1、婚姻关系存续期间购买并取得经济适用房的为夫妻双方共有财产。虽然经济适用房尚未办理产权证，但只要夫妻支付全部购房款的，购买的经济适用房即属于夫妻共同财产;
2、一方婚前申请购买经济适用房，婚后双方共同支付购房款的，为夫妻双方共有财产;
3、一方婚前申请购买并支付部分购房款，婚后夫妻交足购房款的，婚前所支付的购房款对应的房屋价值应当认定为一方个人财产，就补交房款对应的房屋价值应认定为夫妻共有财产;
4、一方婚前购买并已支付全部购房款的为个人财产，房屋应当归买受人所有，即此种情况下经济适用房属于夫妻个人财产。