房屋租赁管理部门根据相关法规和税务部门的委托，对房屋租赁征收租赁管理费，代征私人房屋租赁税和外地驻深企业房屋租赁税。租赁管理费和房屋租赁税都是以租金为基础，按照一定的标准组织征收。
１、房屋租金收入的认定
（１）房屋租金收入的认定原则，房屋租金收入的认定是房屋租赁税费计征的核心问题。房屋租金收入的认定主要有两个原则：一是合同租金与指导租金孰高原则，二是核定租金原则。
①合同租金与指导租金孰高原则，《深圳经济特区房屋租赁条例》第十五条规定：税务部门和区主管机关征收有关税金或者收取房屋租赁管理费时，以指导租金作为计算基数；租赁合同约定的租金高于指导租金时，以合同约定的租金为计算基数。
②核定租金收入原则，以宝安区为例，《宝安区私人房屋租赁税费征收管理暂行办法》把宝安区私人房屋分为居民自建房和居民非自建房、集资房三类进行分类管理。居民非自建房、集资房采用合同租金与指导租金孰高原则确定租金收入。除对需要按实际租金收入开具的居民自建出租房按合同租金与指导租金孰高原则确定租金收入外，其它居民自建房采用核定方式确定租金收入。这种采用核定方式认定的租金称为核定租金。
（２）居民自建房租金收入核定的方法和程序
（３）房屋租赁管理费的计算公式，根据上述规定，可以得到如下基本计算公式：出租人月缴租赁管理费＝租金收入;租赁管理费费率
（４）房屋租赁管理费征收管理程序
①电脑员根据出租人合同登记或备案的房屋租赁情况，于每个季度一个月或每月的１５日前输出《房屋租赁管理费核查表》一式２份，出租人、租赁管理员各一份。
②租赁管理员核对后，对变更的房屋租赁情况进行调查核实。经所长签字，由电脑员输出《房屋租赁管理明细表》一式３份，所长、管理员、收费员各一份；《房屋租赁管理通知单》一式２份，业主（出租人）、管理员各一份。
③收款后，开票人员开具省财政统一印制的行政事业收费收据。如当事人约定，由承租人代交管理费的，收据上的交款人仍应填写出租人的姓名。
④收款人应及时向租赁管理所所长，管理员通报租赁管理费收取情况。对拖延交付管理费的出租人，管理员应填发《限期缴纳房屋租赁管理费通知书》进行催缴。
⑤各租赁管理所于每月的２８日前填写《房屋租赁管理情况统计表》，报市、区租赁管理办。
⑥房屋租赁管理费须及时存入市、区财政部门指定的专户，不得截留、挪用，严格实行收支两条线管理。
（５）法律责任。
①出租人或者转租人不缴纳或者迟延缴纳房屋租赁管理费，主管机关可责令其缴纳，每迟延一日，按应交管理费的数额收取千分之三的滞纳金。
②当事人不服有关行政机关处罚的，可依法申请行政复议或者提起行政诉讼。
③主管机关的管理人员玩忽职守、徇私舞弊的，由其所在单位或者其上级主管部门追究行政责任；构成犯罪的，依法追究刑事责任