分为普通发票丢失补办和增值税发票丢失补办，增值税发票补办方法：1.把存根联复印，2.交客户当地主管税务局确认并出具未抵扣税证明，3.报本公司主管税务局，开具红字发票冲原开发票，4.再重新填开发票给客户。二、增值税发票丢失的补办办法：
1.把存根联复印。
2.交客户当地主管税务局确认并出具未抵扣税证明。
3.报本公司主管税务局，开具红字发票冲原开发票。
4.再重新填开发票给客户。
法律依据
《中华人民共和国发票管理办法》第二十九条 开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存5年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。