“独立核算”与“非独立核算”均属于会计层面的概念，无论选择哪种核算方式，都不会影响分公司的纳税情况。实际上，税法有规定居民企业在中国境内跨地区设立不具有法人资格的营业机构的，应汇总计算并缴纳企业所得税。也就是说，分公司无论怎么核算，都是要汇总缴纳企业所得税的。
《企业所得税法》第五十条 除税收法律、行政法规另有规定外，居民企业以企业登记注册地为纳税地点；但登记注册地在境外的，以实际管理机构所在地为纳税地点。
居民企业在中国境内设立不具有法人资格的营业机构的，应当汇总计算并缴纳企业所得税。