公司最怕员工申请劳动仲裁。如果企业在相关劳资争议纠纷中有过错，是需要承担相应的法律责任的。
根据劳动保障监察条例第五条规定：劳动监察大队如果在劳资争议纠纷中发现企业存在某些不当行为时，可以对企业进行相关罚款处罚。
劳动保障局的处罚就是三种：
一是改正错误，比如欠薪企业照发;
二是企业拒绝劳动保障局的处罚，劳动保障局会与工商局配合吊销企业营业执照;
三是政府部门对企业负责人的处罚，一般是罚款。
《劳动保障监察条例》第十八条 劳动保障行政部门对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，根据调查、检查的结果，作出以下处理：
（一）对依法应当受到行政处罚的，依法作出行政处罚决定；
（二）对应当改正未改正的，依法责令改正或者作出相应的行政处理决定；
（三）对情节轻微且已改正的，撤销立案。
发现违法案件不属于劳动保障监察事项的，应当及时移送有关部门处理；涉嫌犯罪的，应当依法移送司法机关。
法律依据
《劳动保障监察条例》第十八条 劳动保障行政部门对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，根据调查、检查的结果，作出以下处理： （一）对依法应当受到行政处罚的，依法作出行政处罚决定； （二）对应当改正未改正的，依法责令改正或者作出相应的行政处理决定； （三）对情节轻微且已改正的，撤销立案。 发现违法案件不属于劳动保障监察事项的，应当及时移送有关部门处理；涉嫌犯罪的，应当依法移送司法机关。