债务人死亡但是借条上有法人公章的，债权人首先需要确定债务的主体是企业还是个人债务，如果是个人债务的，可以向债务人的继承人追讨债务，如果是企业债务的，应当向企业追讨债务。
【法律依据】
《民法典》第一千一百六十一条，继承人以所得遗产实际价值为限清偿被继承人依法应当缴纳的税款和债务。超过遗产实际价值部分，继承人自愿偿还的不在此限。
继承人放弃继承的，对被继承人依法应当缴纳的税款和债务可以不负清偿责任。