村民自住房买卖合同是否有效要根据不同情况决定：
第一，这类小产权房，具备合法的产权证明，法律规定可以在本集体经济组织成员，也就是同村村民之间进行转让。
第二，对于向村外村民以及城镇居民出售的行为，尽管《土地管理法》第六十三条规定农村集体所有的土地使用权不得出让、转让或者出租用与非农业建设，但《城市房地产管理法》第三十八条也规定了未依法登记领取权属证书的房地产，不得转让，这些规定并不属于效力性强制性规范，不能以此直接否定房屋买卖合同的效力。
从目前司法实践来看，对小产权房买卖合同效力的认定主要适用《合同法》，而合同法的基本精神是意思自治、诚实信用。如确认此类合同无效，出卖方很可能是在违规出卖房屋获得利益以后，再基于土地升值、拆迁补偿等原因主张合同无效，使得遵守诚实信用原则的买房者蒙受损失，从而损害社会的公序良俗和诚实信用的社会根基。因此，合法的小产权房买卖体现了当事人意思自治的原则，应倾向于认定合同有效。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》第六十三条
土地利用总体规划、城乡规划确定为工业、商业等经营性用途，并经依法登记的集体经营性建设用地，土地所有权人可以通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用，并应当签订书面合同，载明土地界址、面积、动工期限、使用期限、土地用途、规划条件和双方其他权利义务。
前款规定的集体经营性建设用地出让、出租等，应当经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意。
通过出让等方式取得的集体经营性建设用地使用权可以转让、互换、出资、赠与或者抵押，但法律、行政法规另有规定或者土地所有权人、土地使用权人签订的书面合同另有约定的除外。