剥夺政治权利的执行机关根据犯罪分子被判处的刑罚不同而有所不同：
一、对于被判处有期徒刑、无期徒刑、死刑缓期二年执行。死刑的犯罪分子，由监狱管理机关执行剥夺政治权利的刑罚。
二、对于被判处管制、拘役的犯罪分子，由公安机关执行剥夺政治权利的刑罚。
【法律依据】
《刑法》第五十四条，剥夺政治权利是剥夺下列权利：
（一）选举权和被选举权；
（二）言论、出版、集会、结社、游行、示威自由的权利；
（三）担任国家机关职务的权利；
（四）担任国有公司、企业、事业单位和人民团体领导职务的权利。