1、孕妇主动提出辞职申请，此时公司无须支付补偿金或“三期”工资。依据《劳动合同法》37条规定，孕妇可以提前三十日以书面形式向公司提交辞呈解除劳动合同，此时是孕妇个人原因解除劳动合同，公司无须支付任何经济补偿包括“三期”工资。
2、双方协商一致解除合同，区分是公司先提出还是孕妇先提出。
(1)孕妇提出解除劳动合同，视为孕妇自身主动放弃“孕妇保护条款”-顺延“三期”劳动合同的权利，属于劳动者自身原因解除劳动合同，无法获得公司的补偿。
(2)如果是公司首先提出解除劳动合同，那么公司应当支付解除劳动合同的经济补偿金，以劳动者在公司工作的年限数额为准，支付相应月份的工资作为补偿金，不满6个月的记为半个月工资，超过6个月的记为一个月工资(如工作了3年5个月，需要支付补偿金为3.5*月工资)。
3、公司依据法定理由合法解除劳动合同(如劳动合同期限届满或用人单位以客观经济情况发生重大变更变化、经济性裁员为由)，孕妇不同意的，劳动合同应当顺延至“三期”结束。这种情形下，有两种解决方式：
(一)孕妇接受公司的建议，解除劳动合同并获得相应的经济补偿金;
(二)孕妇不同意解除，劳动合同顺延至“三期”结束，此期间孕妇可以继续提供劳动获得工资，若“三期”结束公司仍决定解除劳动关系，应当给予经济补偿。
在此种情形下，解除劳动合同的经济补偿金和“三期”工资不可兼而取之。
4、公司违法解除劳动合同的，应当进行经济补偿。但对于违法解除情形下经济赔偿金和“三期”工资能否同时获得支持仍有所争议，有观点认为只需支付经济赔偿金即可，有观点认为需要同时支付经济赔偿金和三期工资。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》第十九条 劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期。以完成一定工作任务为期限的劳动合同或者劳动合同期限不满三个月的，不得约定试用期。试用期包含在劳动合同期限内。劳动合同仅约定试用期的，试用期不成立，该期限为劳动合同期限。