公司注销后员工能申请劳动仲裁。
如果劳动争议发生时，用人单位进入破产清算，那么劳动者仍可在仲裁时将其列为被申请人，清算组可以代表破产企业参加诉讼和仲裁活动。如果已经清算完毕，那么劳动者可以将接收清算资产的股东列为被申请人申请仲裁。
【法律依据】
《劳动人事争议仲裁办案规则》第六条，发生争议的用人单位未办理营业执照、被吊销营业执照、营业执照到期继续经营、被责令关闭、被撤销以及用人单位解散、歇业，不能承担相关责任的，应当将用人单位和其出资人、开办单位或者主管部门作为共同当事人。