职工停职后的处理办法：如果法律、行政法规有相关规定的，按其规定处理；没有相关规定的，单位可按照其依法制定的规章制度来处理；如果规章制度未规定的，则可按照行业的习惯等来处理。单位不得在此期间随意克扣或者拖欠职工的工资。机关和事业单位各类工作人员在停职审查期间，遇国家规定调整工资（含调整标准、晋升工资档次和级别工资）时，其工资调整暂缓执行。待审查结束有结论后，按照有关规定办理，未受到行政处罚或行政纪律处分的，按国家规定予以补调和补发工资。
法律依据
《中华人民共和国劳动法》第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。