工程索赔的处理原则如下：
第一，索赔必须以合同为依据。遇索赔事件时，监理工程师应以完全独立的身份，站在客观公正的立场上，依合同为依据审查索赔要求的合理性、索赔价款的正确性。另外，承包商也只有以合同为依据提出索赔时，才容易索赔成功。
第二，及时、合理处理索赔。如承包方的合理索赔要求长时间得不到解决，积累下来可能会影响其资金周转，从而影响工程进度。此外，索赔初期可能只是普通的信件来往的单项索赔，拖到后期综合索赔，将使索赔问题复杂化，大大增加处理索赔的难度。
第三，必须注意资料的积累：积累一切可能涉及索赔论证的资料，技术问题、进度问题和其他重大问题的会议应做好文字记录，并争取会议参加者签字，作为正式文档资料。同时应建立严密的工程日志，建立业务往来文件编号档案等制度，做到处理索赔时以事实和数据为依据。
第四，加强索赔的前瞻性，有效避免过多的索赔事件的发生。监理工程师应对可能引起的索赔有所预测，及时采取补救措施，避免过多索赔事件的发生。