选择在当地人民法院备案的具有鉴定资质的鉴定机构来鉴定。一般鉴定机构不接受个人委托，所以当事人可以申请由公安机关交通管理部门或律师事务所来委托鉴定，也可以起诉到法院后由双方共同申请由法院委托鉴定。
【法律依据】
《交通事故处理程序规定》第四十条第二款，在交通事故中受害人因交通事故导致残疾的的，在治疗结束之后，应该由具备资格的伤残鉴定机构认定伤残等级，并出具相关的证明书。同时具备资格的机构应该及时给省级人民政府有关管理部门备案，有关管理部门可以及时给交通事故受害人介绍符合条件的检机构由交通事故受害人根据意思自治原则自行选择。