一、处理公司债务纠纷首先要防患于未然
（一）处理公司债务纠纷注意防患于未然是维护企业自身权益的前提基础
因为公司债务纠纷在许多情况下是可以避免的。现代交易，实际上就是合同交易，是口头或书面合同的具体履行，但是合同在订立履行时会遇到很多风险。签订合同的方式一般采用口头合同，这样造成的结果往往是一旦对方不认帐，就会引起公司债务纠纷。
（二）处理公司债务纠纷注意不能口头约定
即使签订了书面协议， 有些合同上仅仅有对方经手人的签字，而没有加盖单位的合同专用章，一旦对方否认经手人的代理资格时，就会使我们陷入不利境地，从而会导致公司债务纠纷的产生。所以， 交易条件不能由双方口头约定，必须使用书面形式，并加盖客户单位的合同专用章。
（三）处理公司债务纠纷注意书面形式不是指书面协议
合同法上规定的书面形式是指合同书，信件和数据电文（包括电报，电信传真，电子数据交换和电子邮件）等可以有形地表现所栽内容的形式，而不是单纯的指书面协议。
（四）处理公司债务纠纷注意合同细节规定
而且，我们的许多企业并不注重合同上的细节规定，如在代销合同上写着“售完后付款”，只要对方还有一件货物没有卖出，他就可以名正言顺地不付货款；还有的合同写着“某某月份以后付款”，并没有明确付款的具体日期，这样的规定今后也容易引起公司债务纠纷。
所以在合同订立时不要使用含糊不确定的词语，要知道，合同中的每一个条款，每一句话，每一个字，甚至每一个标点符号都是十分重要的。千万不要忽视合同细节。为了预防日后公司债务纠纷的发生，最好的办法就是让对方在签订合同时进行担保。担保的方式很多，如可以用人的担保保证，物的担保抵押，质押，留置，以及金钱的担保，如定金。这些都是为了确保债权得到清偿而设立的法律措施。
二、处理公司债务纠纷要积极催要货款来避免陷入公司债务纠纷
（一）中国人向来讲人情，重友谊，看发展，认为催款太紧会使对方不愉快，影响以后的交易，一般不到最后日期，不愿意行使自己作为债权人的权利。其实，这是一种错误观念．，如果总是担心对方不高兴，那么永远都会收不到货款，而且未必保证以后的交易能顺利进行。
（二）客户所欠货款越多，支付越困难，越容易转向第三方购买，我们就越不能稳住这一客户，所以还是加紧催收公司债务才是上策，否则超出了诉讼时效就会无法挽回损失。只有钱货两清，才能继续洽谈新的生意。催收货款若不理直气壮，就会被对方牵着鼻子走，本来能够收回的货款也有可能收不回来。
所以，催要货款时最好直截了当的表明自己的来意，不要让对方认为延期还款是理所应当的。
三、处理公司债务纠纷要灵活运用法律规则来维护公司的自身权益
进行公司债务纠纷诉讼是最有效的维权手段，其中蕴涵着众多的因素，比如如何顺延诉讼时效，怎样选择最佳的诉讼时期，诉讼之前要做好那些准备工作等等，都会影响诉讼的结果。而且，再成功的诉讼如果没有进行财产保全导致胜诉却无法执行，也不能算是完美的诉讼。所以，企业用公司债务纠纷诉讼手段来维权时，一定要及时准确。