1、法律性质不同
刑事拘留是一种预防性措施，它是针对可能出现的妨碍刑事诉讼行为而采用的;司法拘留则是一种排除性措施，是针对已经出现的妨碍诉讼活动的严重行为而采取的。
2、法律根据不同
刑事拘留是根据刑事诉讼法的规定采用的;司法拘留则是分别根据刑事诉讼法、民事诉讼法和行政诉讼法的规定采用的。
3、适用对象不同
刑事拘留是刑事诉讼法规定的刑事诉讼强制措施，适用对象仅限于刑事案件中的现行犯或者重大嫌疑分子。司法拘留的适用对象是所有在诉讼过程中实施了妨害诉讼行为的人，既包括诉讼当事人和其他诉讼参与人，也包括案外人。
4、采用的机关不同
刑事拘留依法由公安机关、人民检察院决定，并由公安机关执行。司法拘留依法由人民法院决定并由人民法院司法警察执行。
5、与判决的关系不同
刑事拘留的期限可以折抵刑期。司法拘留仅仅是对有妨害诉讼行为人的惩戒，与判决结果无任何关系。
6、期限不同
刑事拘留期限已于前述;司法拘留的期限则最长为15日。