承担总量控制、入河排污口设置、排污许可、环评审查，生态环境规划、水功能区划等相关工作，承担河湖岸线开发、生态流量水量、自然保护地、生态保护红线等监管工作，承担水功能区、饮用水、地下水等污染防治和规划环评、项目环评及排污许可事中事后监管等工作，参与河湖长制实施、流域生态保护与修复、生态保护补偿工作。