Nghiên cứu sinh viện thành lập về sau, bởi vì đủ loại nguyên nhân, nghiên cứu sinh viện nghiên cứu sinh giáo dục chưa bị nạp vào quốc dân giáo dục hệ thống, ảnh hưởng Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh giáo dục phát triển tốc độ, khiến cho Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh giáo dục quy mô xa không thể thích ứng khoa học nghiên cứu phát triển yêu cầu, quốc gia sáng tạo hệ thống xây dựng yêu cầu, quốc gia kinh tế xây dựng cùng xã hội phát triển yêu cầu. Theo tri thức sáng tạo công trình không ngừng thâm nhập khai triển, Trung Quốc viện khoa học vẫn chưa hình thành thích ứng sáng tạo hệ thống sở yêu cầu nghiên cứu sinh giáo dục quản lý hệ thống, kiện toàn giáo dục quản lý cơ cấu trở thành hạng nhất quan trọng công tác. Tại đây loại bối cảnh hạ, Trung Quốc viện khoa học với 2000 năm 6 nguyệt tại Thượng Hải triệu khai giáo dục công tác hội nghị, sẽ thượng toàn viện hình thành sáng lập tân nghiên cứu sinh viện chung nhận thức.
2000 năm 7 nguyệt, Trung Quốc viện khoa học thành lập “Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh viện trù hoạch kiến lập công tác tiểu tổ”, bắt đầu tân nghiên cứu sinh viện trù hoạch kiến lập công tác.
2000 năm 9 nguyệt 20 ngày, Trung Quốc viện khoa học hướng Quốc Vụ Viện đệ trình 《 về Trung Quốc khoa học kỹ thuật đại học nghiên cứu sinh viện ( Bắc Kinh ) thay tên vì Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh viện báo cáo 》, đem lúc ấy toàn viện 109 cái viện nghiên cứu nghiên cứu sinh giáo dục tiến hành thể chế cơ chế cải cách cùng tài nguyên chỉnh hợp, ở Trung Quốc khoa học kỹ thuật đại học nghiên cứu sinh viện ( Bắc Kinh ) cơ sở thượng, thay tên tổ kiến Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh viện.
2000 năm 12 nguyệt 29 ngày, Quốc Vụ Viện học vị ủy ban, giáo dục bộ hạ phát 《 về đồng ý điều chỉnh Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh bồi dưỡng cùng học vị trao quyền quản lý thể chế cập thay tên ý kiến phúc đáp 》, Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh viện chính thức thay tên tổ kiến, cũng đem Trung Quốc viện khoa học 5 cái học bộ cùng làm học vị trao tặng đơn vị các viện nghiên cứu 18 cái một bậc ngành học tiến sĩ học vị trao quyền điểm, 24 cái nhị cấp ngành học tiến sĩ học vị trao quyền điểm, 23 cái nhị cấp ngành học thạc sĩ học vị trao quyền điểm đưa về Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh viện. Từ đây, Trung Quốc viện khoa học nghiên cứu sinh giáo dục tiến vào một cái mới tinh phát triển giai đoạn.
2001 năm 2 nguyệt, Trung Quốc viện khoa học hạ phát văn kiện, minh xác nghiên cứu sinh viện “Tam thống nhất, bốn kết hợp” quản lý trường học phương châm, tức “Thống nhất chiêu sinh, thống nhất giáo dục quản lý, thống nhất học vị trao tặng” chức năng cùng “Viện sở kết hợp lãnh đạo thể chế, viện sở kết hợp thầy giáo đội ngũ, viện sở kết hợp quản lý chế độ, viện sở kết hợp bồi dưỡng hệ thống” tổ chức hình thức. Cùng năm 5 nguyệt 22 ngày, tân nghiên cứu sinh viện thay tên thành lập bóc bài nghi thức ở Bắc Kinh ngọc tuyền lộ viên khu long trọng cử hành, tiêu chí nghiên cứu sinh viện xây dựng cùng phát triển từ đây tiến vào một cái tân lịch sử thời kỳ.